原標(biāo)題:北大課題組最新研究提示:新型冠狀病毒中間宿主或?yàn)樗?/p>
新型冠狀病毒可能具有與SARS病毒類似的感染力。
新京報快訊(記者 許雯)新型冠狀病毒的傳染源至今未明。北京大學(xué)工學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系教授朱懷球團(tuán)隊(duì)1月24日發(fā)表的研究文章提示,蝙蝠和水貂可能是新型冠狀病毒的兩個潛在宿主,其中水貂可能為中間宿主。
上述研究文章題為“深度學(xué)習(xí)算法預(yù)測新型冠狀病毒的宿主和感染性”,發(fā)表于bioRxiv預(yù)印版平臺,研究使用的是基于深度學(xué)習(xí)算法開發(fā)的VHP(病毒宿主預(yù)測)方法,用以預(yù)測新型冠狀病毒潛在宿主。
研究提示,與感染其他脊椎動物的冠狀病毒相比,蝙蝠SARS樣冠狀病毒與新型冠狀病毒具有更相似的感染模式。此外,通過比較所有宿主在脊椎動物上的病毒傳染模式,發(fā)現(xiàn)水貂病毒的傳染性模式更接近新型冠狀病毒。
這說明,蝙蝠和水貂可能是新型冠狀病毒的兩個潛在宿主。
記者注意到,1月23日,中國科學(xué)院武漢病毒研究所研究員石正麗團(tuán)隊(duì)在bioRxiv預(yù)印版平臺上發(fā)表文章“一種新型冠狀病毒的發(fā)現(xiàn)及其可能的蝙蝠起源”。該研究表明,新型冠狀病毒的自然宿主最有可能是蝙蝠,它與云南菊頭蝠中存在的RaTG13冠狀病毒一致性高達(dá)96%。
病毒感染力方面,朱懷球團(tuán)隊(duì)研究表明,新型冠狀病毒的6個基因組都極有可能感染人類。預(yù)測結(jié)果提示,新型冠狀病毒具有與嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS樣冠狀病毒(Bat SARS-like CoV)和中東呼吸綜合征冠狀病毒(MERS-CoV)類似的感染人類的強(qiáng)大潛力。
[對話]
課題組成員、浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一醫(yī)院、傳染病診治國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室副主任肖永紅
“新型冠狀病毒與SARS病毒相似度很高”
新京報:研究有哪些主要發(fā)現(xiàn)?
肖永紅:新型冠狀病毒肺炎暴發(fā)以來,病毒的傳染源一直沒有找到。我們利用深度學(xué)習(xí)算法,分析了現(xiàn)有數(shù)據(jù),包括新型冠狀病毒及其他冠狀病毒的基因序列,以及GenBank(基因數(shù)據(jù)庫)中所有可用的脊椎動物病毒數(shù)據(jù)等。
研究發(fā)現(xiàn),新型冠狀病毒與其他冠狀病毒有相似的傳染過程。蝙蝠身上有多種冠狀病毒,這些冠狀病毒可能先傳染至哺乳動物,再傳染到人。比如MERS病毒,中間宿主就是駱駝。
對于新型冠狀病毒來說,研究預(yù)測,蝙蝠是它的最主要來源,中間宿主可能是水貂。
新京報:研究主要基于日前公布的新型冠狀病毒全基因序列嗎?
肖永紅:是的。對科學(xué)研究來說,病毒全基因序列非常重要。新型冠狀病毒和相似病毒的進(jìn)化分析,新型冠狀病毒的檢測方法,都基于全基因序列。另外,病毒發(fā)病機(jī)制研究、新型冠狀病毒治療藥物及疫苗的研發(fā),也基于全基因序列。
新京報:從全基因序列看,新型冠狀病毒與SARS病毒有什么關(guān)聯(lián)?
肖永紅:我認(rèn)為它和SARS病毒的類似度很高。首先,新型冠狀病毒與SARS病毒同屬于冠狀病毒的β屬,而且兩種病毒的基因組序列80%相同,同源性很高。其次,從現(xiàn)有研究看,兩種病毒入侵人體細(xì)胞的主要受體都是ACE2。第三,新型冠狀病毒感染的肺炎發(fā)病時間也和SARS相似。
兩者不是完全相同的病毒,但關(guān)聯(lián)性很高。
新京報:昨天中國疾控中心首次公布成功分離的我國第一株病毒毒種信息及其電鏡照片,這意味著什么?
肖永紅:全基因序列是拿到了病毒的信息,中國疾控中心在實(shí)驗(yàn)室中把病毒培養(yǎng)出來了,這對于研究病毒致病機(jī)制、藥物研發(fā)都非常有幫助,奠定了非常好的基礎(chǔ)。通俗地說,全基因組序列找到了“賊”的證據(jù),現(xiàn)在是把“賊”抓住了。
新京報記者 許雯